現代日本的高中生「砂冢茂」跟他的同學「風間明夫」一起去了只限風間家的一家之主才能去的聖域，聖域裡有三座圍成三角形的鳥居，當到了某個季節特定的時間時，就會產生一股神秘的力量，將人捲入時空之中，回到了日本的戰國時代。他們兩人回到了慶長八年(公元1603年)，被捲入「風魔」和「伊賀」忍者之間的戰鬥中。之後，他們的級任導師「小香香」竟然也回到了過去…… 現代的少年們，被夕陽光芒照耀著的〈通往異世界之門〉給吸了進去，他們抵達的地方是…〈伊賀忍者〉和〈風魔忍者〉搏命相戰的江戶時代戰場！這些少年被捲入了紛爭之中，遇到了風魔忍者裡的少女・風祭陽子…越過時空的邂逅，讓他們的命運大為改變―― 現代的少年們，被夕陽光芒照耀著的〈通往異世界之門〉給吸了進去，他們抵達的地方是…〈伊賀忍者〉和〈風魔忍者〉搏命相戰的江戶時代戰場！這些少年被捲入了紛爭之中，遇到了風魔忍者裡的少女‧風祭陽子…越過時空的邂逅，讓他們的命運大為改變
